Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms