Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nkx6-3Q3UHX8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Nkx6-3Q3UHX8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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