Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip13Q3UA06 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms