Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q3U595 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U595 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U595 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U595 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U595 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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