Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sec24aQ3U2P1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sec24aQ3U2P1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms