Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fam193bQ3U2K0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fam193bQ3U2K0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms