Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc9Q3U0M1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc9Q3U0M1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms