Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc28Q3TX51 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms