Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TchpQ3TVW5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms