Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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