Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt2Q3TTY5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms