Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3TTJ4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.3 ms