Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxw18Q3TSA9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms