Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gtf2f1Q3THK3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms