Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms