Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ap5b1Q3TAP4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms