Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Prr27Q3SYJ2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Prr27Q3SYJ2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms