Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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H2-M3Q31093 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-M3Q31093 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms