Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN8

Defb25, Beta-defensin 25, mousemouse

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Defb25Q30KN8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Defb25Q30KN8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defb25Q30KN8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms