Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbp8Q2V6D6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbp8Q2V6D6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms