Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chrna5Q2MKA5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chrna5Q2MKA5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms