Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpusd2Q149F1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms