Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gli2Q0VGT2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms