Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp2b3Q0VF55 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms