Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cpne7Q0VE82 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms