Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rab42Q0PD08 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rab42Q0PD08 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms