Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TrioQ0KL02 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TrioQ0KL02 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms