Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kndc1Q0KK55 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms