Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc7a1Q09143 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms