Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cass4Q08EC4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms