Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Q08AU9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Q08AU9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q08AU9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q08AU9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q08AU9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q08AU9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q08AU9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q08AU9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q08AU9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q08AU9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Q08AU9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Q08AU9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms