Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ssrp1Q08943 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms