Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gata4Q08369 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gata4Q08369 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms