Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sox4Q06831 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms