Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tie1Q06806 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms