Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col9a1Q05722 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms