Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rcn1Q05186 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rcn1Q05186 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms