Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sox13Q04891 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sox13Q04891 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms