Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox10Q04888 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox10Q04888 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms