Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smarcad1Q04692 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms