Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms