Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg2Q03517 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms