Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Crisp3Q03402 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Crisp3Q03402 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms