Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms