Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cacna1sQ02789 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cacna1sQ02789 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cacna1sQ02789 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms