Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VcpQ01853 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VcpQ01853 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms