Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mc1rQ01727 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mc1rQ01727 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms