Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
EgfrQ01279 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EgfrQ01279 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms