Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Col1a2Q01149 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Col1a2Q01149 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms