Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbp1Q00915 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms